1、真菌通常又分為三類，即”酵母菌“、“霉菌”和“蕈菌”（大型真菌）。

2、酵母菌：是一些單細胞真菌，并非系統演化分類的單元。一種肉眼看不見的微小單細胞微生物，能將糖發酵成酒精和二氧化碳，分布于整個自然界，是一種典型的兼性厭氧微生物，在有氧和無氧條件下都能夠存活，是一種天然發酵劑。

3、霉菌：是絲狀真菌的俗稱，意即"發霉的真菌"，它們往往能形成分枝繁茂的菌絲體，但又不象蘑菇那樣產生大型的子實體。在潮濕溫暖的地方，很多物品上長出一些肉眼可見的絨毛狀、絮狀或蛛網狀的菌落，那就是霉菌。

4、蕈菌：英語中的mushroom是一個多義詞，作為生物名稱通常譯作蘑菇，是指擔子菌中的那些傘菌，特別是雙孢菇中的白蘑菇。mushroom還有一個更廣義的解釋，指能形成大型肉質子實體的真菌，與macrofungi 同義，這一語義按照國際知名學者張樹庭的建議譯作蕈菌。